8月18日,我校基础医学院王栋团队、药学院邓赟团队和格物致和生物科技(北京)有限公司许俊泉团队合作,在世界顶级期刊《Nature Methods》(《Nature》大子刊,中科院一区TOP期刊)上发表题为《High-throughput profiling of chemical-induced gene expression across 93,644 perturbations》的研究论文。成都中医药大学为论文第一完成单位,成都中医药大学2025届博士研究生向磊、成都中医药大学汪玉梅博士、格物致和生物科技(北京)有限公司邵伟博士为论文的共同第一作者,王栋、邓赟、许俊泉为共同通讯作者。

对细胞在各种扰动后的基因表达谱进行大规模、高通量检测,是目前生物医学领域的前沿。然而,当前常用的基因表达谱检测方法仍存在检测通量有限、成本高昂和耗时长等问题。为解决这些难题,该研究成功开发了一种用于大规模基因表达谱检测新技术HiMAP-seq;构建了一个涵盖13,221种化合物、3.19亿条药物扰动基因表达原创数据的数据库CIGS,其中包括全球最大的中药化合物扰动基因表达谱数据集;该数据库已通过交互式在线平台面向全球科研人员免费开放(https://cigs.iomicscillos.com/)。
该研究是我国中医药院校首次以第一完成单位在《Nature Methods》发表研究论文,标志着我校在中医药现代化、数据驱动药物发现、交叉融合技术创新方面取得的创新突破。HiMAP-seq技术的建立以及CIGS数据库的开放共享,不仅为中医药科学内涵解析、中药新药研发提供了关键技术手段,大幅拓展当前基因表达谱研究的广度和深度,也为基于人工智能的药物发现、虚拟细胞等前沿研究提供了原创大数据支撑。
(文、图/科技处 基础医学院 审稿/张定堃 编辑/张希 终审/王其奇)